Tüp bebek tedavisinde kullanılan iğneler ve hormon ilaçları hakkında en çok endişe duyulan konulardan biri, bu tedavinin kansere veya erken menopoza yol açıp açmadığıdır. Yapılan uzun vadeli ve kapsamlı bilimsel çalışmalar, tüp bebek ilaçlarının kanser riskini artırmadığını net bir şekilde kanıtlamaktadır.
Ayrıca, tedavi sürecinde kullanılan hormonlar kadının yumurta rezervini tüketerek onu erken menopoza sokmaz. Bu ilaçlar sadece o ay vücudun doğal döngüsünde zaten gözden çıkarıp yok edeceği yumurtaların büyümesini ve gelişmesini sağlar. Dolayısıyla gelecekteki yumurta kapasitesi bu süreçten hiçbir şekilde olumsuz etkilenmez.